产品货号:
WH0059
中文名称:
微量样本总RNA提取试剂盒
英文名称:
Total RNA Extraction Kit
产品规格:
50次
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1~3天
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本制品可以从微量的组织和细胞(少至10个细胞)中进行RNA提取,本制品在裂解液中添加了特殊组分,可大幅度提高RNA和硅基质膜的选择性结合能力。同时,在RNA提取过程中,还加入RNase-Free DNase I,可去除痕量DNA杂质,而RNase-Free DNase I和其他残留的物质会在随后的漂洗过程中去除,从而有效地保证了提取RNA的得率和纯度。
与其它提取RNA的普通方法相比,本试剂盒将所有<200bp的RNA(5.8S rRNA,5S rRNA和tRNAs等)选择性的筛除,而所有>200bp的RNA则被富集、分离和纯化。提取的总RNA纯度极高,没有DNA和蛋白质污染。
- 从微量的样本中纯化得到的高质量的RNA,如显微切割得到的组织,纤维组织和细胞。
- 配有高效的DNase I,可有效去除DNA污染。
- RNA纯度更高,无杂质残留,特别适合于对纯度要求很高的下游实验。
- 操作安全可靠,无需酚/氯仿抽提,无需氯化铯梯度离心,无需氯化锂或乙醇沉淀。
- RT-PCR。
- Northern Blot、Dot Blot。
- Real-Time PCR。
- 芯片分析。
- polyA筛选、体外翻译、RNase保护分析和分子克隆。
包装 | 组分 | 规格 |
包装一 | 裂解液RL | 30mL |
去蛋白液RW1 | 40mL | |
漂洗液RW | 12mL | |
Carrier RNA | 310μg | |
RNase-Free ddH2O | 1mL | |
RNase-Free ddH2O | 2×15mL | |
RNase-Free吸附柱CR1(含2mL收集管) | 50套 | |
RNase-Free离心管(1.5mL) | 50个 | |
包装二 | RNase-Free DNase I | 1500U |
RDD缓冲液 | 4mL | |
RNase-Free ddH2O | 1mL |
保存:包装一室温保存,包装二2~8℃保存,有效期1年。
蛋白酶K(货号:WH0236)、过滤柱CS
β-巯基乙醇、无水乙醇、1.5mL RNase-Free离心管
- 在本说明书中,对于不同的样品有不同的操作步骤,这些步骤的区别主要在于样品的裂解和结合至硅基质膜的条件不同,当RNA结合至硅基质膜后,后续步骤基本类似。
- 样品使用量的确定:为了使用本试剂盒得到高质量和高纯度的RNA,使用样品的量是否得当很重要,因为吸附柱的吸附量以及裂解液的用量有一定限制,只有保证样品充分的裂解及RNA充分吸附在硅基质膜上,RNA的得率才有保证。
表1:微量样品RNA提取试剂盒技术指标
表2:不同培养条件下HeLa细胞的数量最大吸附能力 45μg RNA 吸附柱最大容量 700μL 提取RNA的长度 >200bp 最小洗脱体积 10μL 样品使用最大量(动物细胞) 5×105 样品使用最大量(动物组织) 5mg 细胞培养器皿 生长面积(cm2) 细胞数量 96孔细胞培养板 0.32~0.6 4~5×104 48孔细胞培养板 1 1×105 24孔细胞培养板 2 2.5×105 12孔细胞培养板 4 5×105 6孔细胞培养板 9.5 1×106 平皿(35mm) 8 1×106 摇瓶(40~50mL) 25 3×106 - 样品的储存和处理:组织若不经过处理,其中的RNA处于无保护状态,容易被降解,所以新鲜组织应及时放入液氮中速冻并立即储存于-70℃,冻存的组织不能反复冻融以避免RNA的降解,样品液可以匀浆后加入裂解液RL,储存于-70℃,冻存的样品可稳定储存数月。
- 样品的裂解和均质:有效的裂解和均质是提取RNA的重要步骤,裂解和均质是两个不同的步骤。
- 裂解:将组织和细胞完全裂解,以彻底释放出样品中所有的RNA,不同的样品裂解的方法不同,如果样品裂解不彻底,将导致RNA得率低。
- 均质:均质的过程是为了降低细胞裂解后的溶液粘度,将高分子量的基因组DNA和其他物质切断,形成均一的溶液,利于RNA与硅基质膜的结合。如果均质过程未处理好,将影响RNA与硅基质膜的结合,从而导致RNA提取量低。均质的方法包括匀浆、涡旋震荡、过滤柱、注射器或枪头吸取等。
- 裂解:将组织和细胞完全裂解,以彻底释放出样品中所有的RNA,不同的样品裂解的方法不同,如果样品裂解不彻底,将导致RNA得率低。
- Carrier RNA:当处理<10μg组织或<5000个细胞时,可将试剂盒中提供的Carrier RNA加入裂解液中,实验证明,Carrier RNA的加入将提高RNA的得率,且不会影响后续实验。
- 为了防止RNA的降解,请避免未处理的样品在室温长时间放置,在组织固定前,RNA处于无保护状态,所以请将组织在液氮中速冻。
- 组织裂解液(在裂解液RL中)可在-70℃储存数月。处理冻存的裂解液时,可在室温或37℃水浴中将样品完全解冻,而且请注意裂解液中的盐需要完全溶解,之后立即进行后续操作。(长时间37℃处理将会导致RNA的化学降解)。
- 所有步骤在室温进行,为了尽量避免RNA的降解,操作越快越好。
- 在使用前,请用RNase-Free ddH2O配制乙醇溶液。
- 操作前在RL中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1mL RL中加入10μL β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RL可在4℃放置一个月,裂解液RL在储存时可能会形成沉淀,如果有沉淀出现,请加热溶解后使用。
- 第一次使用前应在漂洗液RW中加入无水乙醇,加入量请参见瓶上标签。
- DNase I储存液的配制:请小心打开装有DNase I的玻璃管盖子,以避免造成DNase I的损失,将DNase I干粉(1500U)溶解在550μL RNase-Free水中,轻柔地上下颠倒混匀DNase I溶液,不要涡旋振荡。
如需长时间保存DNase I溶液,请将玻璃瓶中的DNase I溶液进行分装,在-30~-15℃可保存9个月,DNase I溶液融化后可在2~8℃保存6周,溶解后的DNase I溶液不能再次冷冻。 - Carrier RNA储存液的配制:在第一次使用Carrier RNA时,将Carrier RNA(310μg)溶解在1mL RNase-Free ddH2O中,将溶液分装后储存于-30~-15℃,此时该溶液的浓度为310μg/mL(310ng/μL);该储存液应避免反复冻融,冻融次数不能超过3次。(当处理的细胞量小于5000个时,请在裂解液中加入Carrier RNA。)
- Carrier RNA工作溶液的配制(以配制10次用量为例):将5μL Carrier RNA储存溶液加入34μL裂解液RL中,用移液器混匀,将混匀后的溶液6μL加入54μL裂解液RL中,此时Carrier RNA终浓度为4ng/μL,取5μL终浓度为4ng/μL的Carrier RNA加入裂解液中。
一从微切割的冷冻样品中提取总RNA
以下的操作步骤适用于从冷冻的微切割动物组织中分离RNA。要从非常微量的样品中提取RNA是一项很有挑战性的工作,同时要注意,固定和处理样品的过程可能会对RNA完整性造成影响。
- 向样品中加入适量的裂解液RL(使用前请加入β-巯基乙醇,终浓度为1%) (加入裂解液RL的体积与微切割仪器容积有关,但不能超过最大体积为(A) 65μL (B) 300μL。)
- (A)指的是微切割仪器Leica AS LMD系统可采用的体积,(B)指的是其他微切割系统可使用的裂解液体积,以下出现的(A) (B)与此一致。
- 如果需要,可将样品和裂解液RL转移至一个较大的1.5mL或2mL RNase-Free的离心管中(客户自备)。补充裂解液RL至体积为(A)75μL (B)350μL。
- (A) (B)所指的意义同步骤1,当处理的细胞量小于5000个时,向溶液中加入20ng Carrier RNA(5μL 4ng/μL Carrier RNA),Carrier RNA溶液的配制请见“溶液配制”说明。
- 涡旋振荡30sec,使样品匀质化。
- 向样品中加入1倍体积((A)75μL (B)350μL)70%乙醇,用移液器混匀,立即进行第5步。
- 如果在匀质的过程中损失了一些裂解液,70%乙醇的加量也要相应减小。在加入乙醇后,溶液中可能会出现沉淀,但不会影响RNA的提取。
- 将所有溶液及沉淀全部转移至吸附柱CR1上(吸附柱CR1放在RNase-Free的2mL收集管中,该收集管试剂盒中已经备有),轻柔地盖上管盖,12000rpm (~13400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- DNase I工作液的配制:取10μL DNase I储存液放入新的RNase-Free离心管中,加入70μL RDD溶液,轻柔混匀。
- 向吸附柱CR1中央加入80μL的DNase I工作液,室温放置15min。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入500μL漂洗液RW(使用前请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 重复步骤10。
- 12000rpm(~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CR1置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
- 此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,离心后将吸附柱CR1在室温放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验。
- 将吸附柱CR1放入一个新的RNase-Free离心管(试剂盒中已备用)中,向膜中央加入14μL RNase-Free ddH2O,轻柔地盖上管盖,室温放置2min。12000rpm (~13400×g)离心1min,所得溶液即为RNA溶液。
- 洗脱体积不得少于10μL,可用减小洗脱体积的方法得到较高浓度的RNA,但是这将影响总的RNA得率。
二、从福尔马林固定的微切割样品中提取总RNA
以下操作步骤适用于从福尔马林固定的微切割样品中提取总RNA。在从福尔马林固定的微切割样品中提取RNA时,主要的影响因素有:样品的新旧程度、固定的过程和样品的储存条件。RNA可能会降解成<300bp的片段,而本试剂盒能有效吸附>200bp的片段,所以如果样品中的RNA高度降解,可能会出现提不出RNA的情况。
- 预先加热水浴至55℃,为第4步中的蛋白酶K消化做准备。
- 向样品中加入适当体积的裂解液RL(使用前请向RL中加入β-巯基乙醇,终浓度1%),加入裂解液RL体积与微切割仪器的容积有关,但不能超过140μL。
- 如果需要,可以将样品和裂解液RL转移至1.5mL或2mL的RNase-Free的离心管中(客户自备)。补充裂解液RL至体积为150μL。
- 当处理的细胞量小于5000时,向溶液中加入20ng Carrier RNA (5μL 4ng/μL Carrier RNA工作液),Carrier RNA工作溶液的配制请见“溶液配制”说明。
- 向溶液中加入295μL RNase-Free ddH2O,然后加入5μL蛋白酶K溶液(浓度20mg/mL,客户自备),用移液器混匀,55℃孵育10min。室温12000rpm (~13400×g)离心3min。
- 此时的组织碎片可能会形成小球,有时在溶液上面会浮有一层薄膜。
- 用移液器将上层溶液(450μL左右)转移至一个新的RNase-Free离心管中(客户自备)。
注意:使用移液器吸取上层溶液时,一定要避免接触到组织碎片小球,而且枪头要伸到薄膜以下进行吸取,避免将薄膜转移至离心管中。 - 向吸出的上层溶液中加入0.5倍体积的无水乙醇(通常为225μL),用移液器混匀。
- 在加入乙醇后,溶液中可能会出现沉淀,但是不会影响RNA的提取。
- 将所有溶液及沉淀全部转移至吸附柱CR1上(吸附柱CR1放在2mL收集管中,此收集管试剂盒已经备有),轻柔地盖上管盖,12000rpm (~13400×g)离心30~60sec,倒掉废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- DNase I工作液的配制:取10μL DNase I储存液放入新的RNase-Free离心管中,加入70μL RDD溶液,轻柔混匀。
- 向吸附柱CR1中央加入80μL的DNase I工作液,室温放置15min。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入500μL漂洗液RW (使用前请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 重复步骤12。
- 12000rpm(~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CR1置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
- 此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,离心后将吸附柱CR1在室温放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验。
- 将吸附柱CR1放入一个新的1.5mL RNase-Free离心管中(试剂盒中已备有),向膜中央加入14μL RNase-Free ddH2O,轻柔地盖上管盖,室温放置2min。12000rpm (~13400×g)离心1min,所得溶液即为RNA溶液。
- 洗脱体积不得少于10μL,可用减小洗脱体积的方法得到较高浓度的RNA,但是这将影响总的RNA得率。
三、从动物组织中提取总RNA
以下操作适用于从大多数动物组织中提取RNA,如果要从纤维组织中提取RNA,请看“四、从纤维组织中提取总RNA”。从动物组织中提取RNA,若要得到高纯度和高产量的RNA,组织的起始量非常重要,本试剂盒提供的吸附柱CR1最大结合能力为45μg,裂解液最多能裂解5mg的组织。有些组织像脾脏、部分脑组织、肺组织和胸腺组织在提取的过程中有可能会形成一些沉淀,但不会影响RNA的提取。推荐使用的组织量不超过5mg,请不要超过吸附柱CR1的载量,否则将会降低RNA的产量和纯度。
- 确定组织的总量,不要超过5mg,立即进行第2步。
- 在裂解液RL(使用前请加入β-巯基乙醇,终浓度为1%)中将组织块切碎和匀浆(请见步骤2a,2b)
- 组织块的切碎和匀浆过程可采用下列a和b两种方法之一,当处理小于10μg的组织时,需要向裂解液中加入20ng Carrier RNA工作溶液(5μL 4ng/μL),Carrier RNA工作溶液的配制请见“溶液配制”说明。匀浆不彻底将导致RNA提取量低,还可能导致堵塞吸附柱CR11的现象发生。
- 使用匀浆器进行匀浆:
将称重过的组织块放在一个大小合适的容器中,加入350μL裂解液RL,立即进行匀浆至均一溶液(通常时间为20~40sec),继续步骤3。 - 使用研磨杵(客户自备)进行研磨:在1.5mL RNase-Free的离心管中(客户自备)加入350μL裂解液RL,将组织块迅速从-80℃转入这个离心管中,用研磨杵充分研磨,彻底将组织破碎,注意避免组织冻融。将此溶液移至过滤柱CS(客户自备)上(过滤柱CS放在收集管中),12000rpm (~13400×g)离心2min,收集滤液,继续步骤3。
- 将匀浆好的样品(2a)或者过滤液(2b)以12000rpm (~13400×g)离心3min,用移液器仔细将上清液转移到新的1.5mL RNase-Free离心管中(客户自备)。
- 向上清中加入1倍体积(350μL)70%乙醇,用移液器混匀,立即进行第5步。
- 如果在以上过程中损失了一些裂解液,70%乙醇的加量也要相应减小。在乙醇加入后,溶液中可能会出现沉淀,但不会影响RNA的提取。
- 将所有溶液及沉淀全部转移至吸附柱CR1上(吸附柱CR1放在2mL收集管中,试剂盒中已备有),轻柔地盖上管盖,12000rpm (~13400×g)离心30~60sec,倒掉废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- DNase I工作液的配制:取10μL DNase I储存液放入新的RNase-Free离心管中,加入70μL RDD溶液,轻柔混匀。
- 向吸附柱CR1中央加入80μL的DNase I工作液,室温放置15min。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入500μL漂洗液RW (使用前请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 重复步骤10。
- 12000rpm(~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CR1置于室温放置数min,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
- 此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,离心后将吸附柱CR1在室温放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验。
- 将吸附柱CR1放入一个新的RNase-Free离心管中(试剂盒中已备有),向膜中央加入14μL RNase-Free ddH2O,轻柔地盖上管盖,室温放置2min。12000rpm (~13400×g)离心1min,所得溶液即为RNA溶液。
- 洗脱体积不得少于10μL,可用减小洗脱体积的方法得到较高浓度的RNA,但是这将影响总的RNA得率。
四、从纤维组织中提取总RNA
纤维组织,例如骨骼肌、心脏、皮肤中含有大量的收缩蛋白、连接组织和胶原质,只有去除这些蛋白质,才能使RNA的提取顺利进行。所以在从纤维组织中提取总RNA时,引入了蛋白酶K消化这一过程。
采用以下操作,可成功地从心脏、肌肉和皮肤组织中提取RNA,其他富含蛋白质的组织也可采用此方法进行RNA的提取,值得注意的是,在进行蛋白酶K消化过程中的缓冲液不能对RNase进行长期有效的抑制,因而此方法不适用于含有丰富RNase的脾脏和肠组织等RNA的提取。
推荐使用的组织量不超过5mg,请不要超过吸附柱CR1的载量,否则将会降低RNA的产量和纯度。
- 预先加热水浴至55℃,为第4步中的蛋白酶K消化做准备。
- 确定组织的总量,不要超过5mg,立即进行第3步。
- 在裂解液RL(使用前请加入β-巯基乙醇,终浓度为1%)中将组织块匀浆(3a)或者研碎(3b)。
当处理小于10μg的组织时,需要向裂解液中加入20ng Carrier RNA工作液(5μL 4ng/μL溶液),Carrier RNA溶液的配制请见“溶液配制”说明。匀浆不彻底会导致RNA提取量低,还可能导致吸附柱CR1堵塞。采用匀浆器或过滤柱进行匀浆,会比采用其他方式匀浆获得更高的RNA得率。- 使用匀浆器进行匀浆:将称重过的组织块放在一个大小合适的容器中,加入150μL裂解液RL,立即进行匀浆至均一溶液(通常时间为20~40sec),继续步骤4。
- 使用研磨杵(客户自备)进行研磨:在1.5mL RNase-Free的离心管中(客户自备)加入150μL裂解液RL,将组织块迅速从-80℃转入这个离心管中,用研磨杵充分研磨,彻底将组织研碎,注意避免组织冻融,继续步骤4。
- 当使用研磨杵研磨时,请务必将组织彻底研碎,以保证裂解充分。
- 使用匀浆器进行匀浆:将称重过的组织块放在一个大小合适的容器中,加入150μL裂解液RL,立即进行匀浆至均一溶液(通常时间为20~40sec),继续步骤4。
- 向溶液中加入295μL RNase-Free ddH2O,然后加入5μL蛋白酶K溶液(浓度为20mg/mL,客户自备),用移液器混匀。55℃孵育10min。室温12000rpm (~13400×g)离心3min。
- 此时的组织碎片可能会形成小球,有时在溶液上面会浮有一层薄膜。
- 用移液器将上层溶液(通常450μL左右)转移至一个新的1.5mL RNase-Free的离心管中(客户自备)。
- 使用移液器吸取上层溶液时,一定要避免接触到组织碎片小球,而且枪头要伸到薄膜以下进行吸取,避免将薄膜转移至离心管中。
- 向吸出的上层溶液加入0.5倍体积的无水乙醇(通常为225μL),用移液器混匀。
- 在乙醇加入后,溶液中可能会出现沉淀,但是不会影响RNA的提取。
- 将所有溶液及沉淀物质全部转移至吸附柱CR1上(吸附柱CR1放在2mL收集管中,试剂盒已经备有),轻柔地盖上管子,12000rpm (~13400×g)离心30~60sec,倒掉废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- DNase I工作液的配制:取10μL DNase I储存液放入新的RNase-Free离心管中,加入70μL RDD溶液,轻柔混匀。
- 向吸附柱CR1中央加入80μL的DNase I工作液,室温放置15min。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入500μL漂洗液RW (使用前请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 重复步骤12。
- 12000rpm(~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CR1置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
- 此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,离心后将吸附柱CR1在室温放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验。
- 附柱CR1放入一个新的RNase-Free离心管(试剂盒中已备用)中,向膜中央加入14μL RNase-Free ddH2O,轻柔地盖上管盖,室温放置2min。12000rpm (~13400×g)离心1min,所得溶液即为RNA溶液。
- 洗脱体积不得少于10μL,可用减小洗脱体积的方法得到较高浓度的RNA,但是这将影响总的RNA得率。
五、从动物细胞中提取总RNA
从动物细胞中提取RNA,若要得到高纯度和最佳产量的RNA,细胞的起始量非常重要,本试剂盒提供的吸附柱CR1最大结合能力为45μg,而裂解液最多能裂解5×105的细胞。推荐使用的细胞量不超过5×105,请不要超过吸附柱CR1的载量,否则将会降低RNA的产量和纯度。
- 细胞的处理和裂解
- 细胞沉淀:轻弹管底使细胞分开,加入350μL裂解液RL(使用前请加入β-巯基乙醇,终浓度为1%),涡旋振荡或用移液器混匀,继续步骤2。
- 悬浮培养细胞:确定细胞的数量(见表2),在RNase-Free的离心管(客户自备)中300×g离心5min沉淀细胞,去除所有上清,加入350μL裂解液RL(使用前请加入β-巯基乙醇,终浓度为1%),继续步骤2。
- 单层贴壁细胞:对于该种细胞的收集可直接在细胞培养器皿中进行(直径最大为10cm),或者可以先用胰蛋白酶消化,再收集细胞沉淀,进行裂解。
- 直接在细胞培养器皿中进行裂解:
确定细胞数量,将细胞培养基完全吸出,加入350μL裂解液RL(使用前请加入β-巯基乙醇,终浓度为1%)裂解细胞,收集细胞裂解液并将其转移至1.5mL RNase-Free离心管(客户自备)中,涡旋振荡或用移液器混匀,确保看不见任何成团的细胞之后,继续步骤2。 - 胰蛋白酶消化(摇瓶中培养的单层贴壁细胞,通常采用胰蛋白酶消化的方法):
确定细胞数量,吸出培养基,用PBS缓冲液洗细胞,吸除PBS缓冲液,加入含有0.10~0.25%胰蛋白酶的PBS缓冲液处理细胞,在细胞脱离容器壁后,加入含有血清的溶液使胰蛋白酶失活,将细胞转移到RNase-Free的离心管中,300×g离心5min沉淀细胞,仔细去除所有上清。加入350μL裂解液RL(使用前请加入β-巯基乙醇,终浓度1%)裂解细胞。继续步骤2。
- 直接在细胞培养器皿中进行裂解:
- 如果细胞培养基没有去除干净,将会稀释裂解液,影响裂解效果及RNA与硅胶树脂膜的结合,这将导致RNA的提取量降低。
- 当处理的细胞量≤1×105时,裂解液RL的加量可以减少至75μL,这时可采用小一些的离心管,涡旋振荡1min使裂解液匀质化,进行步骤3。
- 如果处理细胞量<5000时,需要向裂解液中加入20ng Carrier RNA (5μL 4ng/μL溶液),Carrier RNA溶液的配制请见“溶液配制”说明。
- 如果细胞重悬不完全,将会导致裂解不充分,降低RNA的产率。
- 细胞沉淀:轻弹管底使细胞分开,加入350μL裂解液RL(使用前请加入β-巯基乙醇,终浓度为1%),涡旋振荡或用移液器混匀,继续步骤2。
- 样品的匀质化(请见步骤2a,2b)
- 匀质不彻底将导致RNA提取量低,还可能导致吸附柱CR1堵塞,采用匀浆器或过滤柱进行匀质,会比采用其他方式匀浆获得更高的RNA得率。
- 将加入裂解液的细胞转移至过滤柱CS(客户自备)上(过滤柱CS放在收集管中),12000rpm (~13400×g)离心2min,收集滤液,继续步骤3。
- 使用匀浆器匀浆30sec。
- 加入1倍体积(通常为350μL)70%乙醇,用移液器混匀,立即进行第4步。
- 如果在匀质的过程中损失了一些裂解液,70%乙醇的加量也要相应减小。如果在第2步中只加入了75μL的裂解液RL,则在本步骤中也只需加入75μL的70%乙醇,加入乙醇后,溶液中可能会出现沉淀,但是不会影响RNA的提取。
- 将所有溶液及沉淀全部转移至吸附柱CR1上(吸附柱CR1放在2mL RNase-Free的收集管中,此收集管试剂盒中已经备有),轻柔地盖上管盖,12000rpm (~13400×g)离心30~60sec,弃废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- DNase I工作液的配制:取10μL DNase I储存液放入新的RNase-Free离心管中,加入70μL RDD溶液,轻柔混匀。
- 向吸附柱CR1中央加入80μL的DNase I工作液,室温放置15min。
- 向吸附柱CR1中加入350μL去蛋白液RW1,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 向吸附柱CR1中加入500μL漂洗液RW (使用前请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,12000rpm(~13400×g)离心30~60sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR1放回收集管中。
- 重复步骤9。
- 12000rpm(~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CR1置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
- 此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,离心后将吸附柱CR1在室温放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验。
- 将吸附柱CR1放入一个新的RNase-Free离心管(本试剂盒中已经备有)中,向膜中央加入14μL RNase-Free ddH2O,轻柔地盖上管盖,室温放置2min。12000rpm (~13400×g)离心1min,所得溶液即为RNA溶液。
- 洗脱体积不得少于10μL,可用减小洗脱体积的方法得到较高浓度的RNA,但是这将影响总的RNA得率。
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